Compete ao Chefe de Setor de Planejamento e Administração em Saúde, a chefia das questões administrativas, como projetos, planejamento, coordenação e promoção de ações de políticas públicas; planejamento de campanhas preventivas; organização dos programas de saúde segundo a realidade local; gerenciamento de assistência médica e odontológica, além da chefia no desenvolvimento dos programas e projetos voltados para a melhoria no atendimento do sistema público de saúde, planejando, coordenando e controlando as atividades deste departamento; planejamento de parcerias e convênios.